PDB Chemical Component VXX

The following tables include covalent bond distance, bond angle and torsion angle values for the experimental model and ideal geometries stored in the definition for this chemical component.

Bond Distances for VXX

Atom I	Atom J	Distance (Experimental Model)	Distance (Ideal Model)
C1	CO1	1.401	1.395
C1	CO2	1.394	1.395
C1	CC	1.460	1.454
CO1	CM1	1.402	1.394
CO1	HO1	1.103	1.087
CO2	CM2	1.389	1.395
CO2	HO2	1.103	1.088
CM1	CZ	1.386	1.395
CM1	HM1	1.103	1.087
CM2	OM	1.362	1.362
CM2	CZ	1.446	1.395
OM	CV	1.439	1.426
CZ	O3	1.369	1.362
CC	O1	1.211	1.238
CC	O2	1.416	1.368
CV	HVC1	1.116	1.093
CV	HVC2	1.115	1.093
CV	HVC3	1.115	1.092
O2	C9	1.425	1.431
O3	H3	0.950	0.970
C9	H9C1	1.115	1.092
C9	H9C2	1.114	1.093
C9	H9C3	1.115	1.093

Bond Angles for VXX

Atom I	Atom J	Atom K	Angle (Experimental Model)	Angle (Ideal Model)
CO1	C1	CO2	121.0	120.0
CO1	C1	CC	119.0	120.0
C1	CO1	CM1	120.5	120.0
C1	CO1	HO1	119.8	120.6
CO2	C1	CC	120.0	120.0
C1	CO2	CM2	118.9	120.0
C1	CO2	HO2	120.5	120.2
C1	CC	O1	123.4	124.5
C1	CC	O2	114.1	111.6
CM1	CO1	HO1	119.7	119.4
CO1	CM1	CZ	119.7	120.0
CO1	CM1	HM1	120.2	119.7
CM2	CO2	HO2	120.5	119.7
CO2	CM2	OM	123.6	119.5
CO2	CM2	CZ	120.6	120.0
CZ	CM1	HM1	120.1	120.3
CM1	CZ	CM2	119.2	120.0
CM1	CZ	O3	123.8	119.5
OM	CM2	CZ	115.7	120.5
CM2	OM	CV	120.8	117.1
CM2	CZ	O3	117.0	120.6
OM	CV	HVC1	120.8	109.5
OM	CV	HVC2	108.1	109.5
OM	CV	HVC3	108.2	109.0
CZ	O3	H3	123.8	110.2
O1	CC	O2	122.4	123.9
CC	O2	C9	118.6	116.9
HVC1	CV	HVC2	108.2	110.1
HVC1	CV	HVC3	108.2	109.4
HVC2	CV	HVC3	101.7	109.4
O2	C9	H9C1	118.6	109.6
O2	C9	H9C2	108.9	109.5
O2	C9	H9C3	108.9	109.0
H9C1	C9	H9C2	108.9	110.1
H9C1	C9	H9C3	108.9	109.3
H9C2	C9	H9C3	101.2	109.4

Torsion Angles for VXX

Atom I	Atom J	Atom K	Atom L	Angle (Experimental Model)	Angle (Ideal Model)
CO2	C1	CO1	CC	179.7	180.0
CO1	C1	CO2	CM2	0.8	0.0
CO1	C1	CO2	HO2	180.8	180.0
CO1	C1	CC	O1	180.3	330.0
CO1	C1	CC	O2	356.7	149.9
CM1	CO1	C1	HO1	180.0	180.0
C1	CO1	CM1	CZ	2.2	0.0
C1	CO1	CM1	HM1	182.3	180.0
CO1	C1	CO2	CC	180.3	180.0
CO2	C1	CO1	CM1	358.0	360.0
CO2	C1	CO1	HO1	178.0	180.0
CO2	C1	CC	O1	0.6	150.0
CO2	C1	CC	O2	176.9	329.9
CM2	CO2	C1	HO2	180.0	180.0
C1	CO2	CM2	OM	179.9	180.0
C1	CO2	CM2	CZ	0.1	360.0
CO1	C1	CC	CO2	179.7	180.0
CC	C1	CO1	CM1	178.2	180.0
CC	C1	CO1	HO1	358.3	0.0
CC	C1	CO2	CM2	180.6	180.0
CC	C1	CO2	HO2	0.6	0.0
O1	CC	C1	O2	183.6	180.1
C1	CC	O2	C9	186.1	180.1
CM1	CO1	C1	CO2	358.0	360.0
CM1	CO1	C1	CC	178.2	180.0
C1	CO1	CM1	HO1	180.0	180.0
CZ	CM1	CO1	HM1	180.0	180.0
CO1	CM1	CZ	CM2	358.7	360.0
CO1	CM1	CZ	O3	179.2	180.0
HO1	CO1	C1	CO2	178.0	180.0
HO1	CO1	C1	CC	358.3	0.0
C1	CO1	HO1	CM1	180.0	180.0
HO1	CO1	CM1	CZ	182.2	180.0
HO1	CO1	CM1	HM1	2.2	360.0
CM2	CO2	C1	CC	180.6	180.0
C1	CO2	CM2	HO2	180.0	180.0
CM1	CZ	CM2	CO2	0.1	0.0
OM	CM2	CO2	CZ	179.8	180.0
CO2	CM2	OM	CV	356.7	90.0
CO2	CM2	CZ	O3	179.7	180.0
HO2	CO2	C1	CC	0.6	0.0
C1	CO2	HO2	CM2	180.0	180.0
HO2	CO2	CM2	OM	359.9	360.0
HO2	CO2	CM2	CZ	180.1	180.0
CZ	CM1	CO1	HO1	182.2	180.0
CO1	CM1	CZ	HM1	180.0	180.0
CO2	CM2	CZ	CM1	0.1	0.0
OM	CM2	CZ	CM1	180.3	180.0
CM2	CZ	CM1	O3	179.5	180.0
CM1	CZ	O3	H3	180.0	323.5
HM1	CM1	CO1	HO1	2.2	360.0
CO1	CM1	HM1	CZ	180.0	180.0
HM1	CM1	CZ	CM2	178.7	180.0
HM1	CM1	CZ	O3	359.2	0.0
OM	CM2	CO2	HO2	359.9	360.0
CO2	CM2	OM	CZ	180.2	180.0
CM1	CZ	CM2	OM	180.3	180.0
OM	CM2	CZ	O3	359.8	360.0
CM2	OM	CV	HVC1	180.0	82.1
CM2	OM	CV	HVC2	54.7	321.4
CM2	OM	CV	HVC3	305.3	201.7
CZ	CM2	CO2	HO2	180.1	180.0
CO2	CM2	CZ	OM	179.8	180.0
CM2	CZ	CM1	HM1	178.7	180.0
CM1	CZ	CM2	O3	180.4	180.0
CZ	CM2	OM	CV	176.5	270.0
CM2	CZ	O3	H3	0.5	143.6
CV	OM	CM2	CZ	176.5	270.0
HVC1	CV	OM	HVC2	125.3	120.8
HVC1	CV	OM	HVC3	234.7	240.4
HVC2	CV	OM	HVC3	109.5	119.6
O3	CZ	CM1	HM1	359.2	0.0
CM1	CZ	O3	CM2	179.5	180.0
C1	CC	O1	O2	176.1	179.9
O1	CC	O2	C9	2.5	360.0
C1	CC	O2	O1	183.6	180.1
CC	O2	C9	H9C1	180.0	353.4
CC	O2	C9	H9C2	54.7	232.6
CC	O2	C9	H9C3	305.3	113.0
OM	CV	HVC1	HVC2	234.8	239.6
OM	CV	HVC1	HVC3	125.3	119.4
HVC2	CV	HVC1	HVC3	250.5	239.8
OM	CV	HVC2	HVC1	132.4	120.4
OM	CV	HVC2	HVC3	246.2	240.6
HVC1	CV	HVC2	HVC3	113.8	120.2
OM	CV	HVC3	HVC1	227.6	240.3
OM	CV	HVC3	HVC2	113.8	119.7
HVC1	CV	HVC3	HVC2	246.2	239.4
H9C1	C9	O2	H9C2	125.2	120.8
H9C1	C9	O2	H9C3	234.7	240.4
H9C2	C9	O2	H9C3	109.5	119.6
O2	C9	H9C1	H9C2	234.8	239.5
O2	C9	H9C1	H9C3	125.3	119.4
H9C2	C9	H9C1	H9C3	250.5	239.9
O2	C9	H9C2	H9C1	130.7	120.5
O2	C9	H9C2	H9C3	245.4	240.6
H9C1	C9	H9C2	H9C3	114.6	120.1
O2	C9	H9C3	H9C1	229.3	240.3
O2	C9	H9C3	H9C2	114.6	119.7
H9C1	C9	H9C3	H9C2	245.4	239.4