PDB Chemical Component SVW

The following tables include covalent bond distance, bond angle and torsion angle values for the experimental model and ideal geometries stored in the definition for this chemical component.

Bond Distances for SVW

Atom I Atom J Distance (Experimental Model) Distance (Ideal Model)
N HN1 1.000 1.006
N HN2 1.001 1.006
CA HC 1.100 1.095
N CA 1.477 1.442
CA C 1.558 1.515
C O 1.249 1.224
CA CB 1.533 1.522
CB OG 1.428 1.422
OG P1 1.564 1.623
O3 P1 1.513 1.506
P1 O4 1.518 1.625
P1 N2 1.745 1.653
C OXT 1.343 1.358
CB HBC1 1.115 1.094
CB HBC2 1.115 1.097
O4 H4 0.950 0.981
N2 H2N1 1.020 1.020
N2 H2N2 1.020 1.019
OXT HXT 4.103 0.981

Bond Angles for SVW

Atom I Atom J Atom K Angle (Experimental Model) Angle (Ideal Model)
HN1 N HN2 109.4 120.7
CA N HN1 109.5 118.9
CA N HN2 109.5 119.0
N CA HC 108.0 105.3
C CA HC 104.9 110.0
CB CA HC 106.3 111.8
N CA C 112.3 107.4
N CA CB 111.0 111.6
CA C O 118.9 125.1
C CA CB 113.8 110.5
CA C OXT 118.6 111.9
O C OXT 122.5 122.9
CA CB OG 111.3 109.2
CA CB HBC1 111.6 111.0
CA CB HBC2 111.5 111.5
CB OG P1 121.8 120.1
OG CB HBC1 111.5 107.9
OG CB HBC2 111.6 108.7
OG P1 O3 92.9 111.6
OG P1 O4 103.8 101.9
OG P1 N2 132.9 107.8
O3 P1 O4 118.8 111.5
O3 P1 N2 103.8 116.4
O4 P1 N2 105.7 106.5
P1 O4 H4 103.8 118.7
P1 N2 H2N1 104.1 117.1
P1 N2 H2N2 132.9 117.1
C OXT HXT 27.4 115.2
HBC1 CB HBC2 98.8 108.5
H2N1 N2 H2N2 104.1 105.7

Torsion Angles for SVW

Atom I Atom J Atom K Atom L Angle (Experimental Model) Angle (Ideal Model)
CA N HN1 HN2 120.0 193.7
HN1 N CA HC 160.9 176.0
HN1 N CA C 45.7 58.7
HN1 N CA CB 277.1 297.5
CA N HN2 HN1 240.0 166.3
HN2 N CA HC 280.9 9.4
HN2 N CA C 165.7 252.2
HN2 N CA CB 37.1 130.9
HC CA N HN1 160.9 176.0
HC CA N HN2 280.9 9.4
N CA HC C 240.0 244.6
N CA HC CB 119.2 121.4
HC CA C O 308.9 210.1
C CA HC CB 239.2 236.8
HC CA C OXT 129.0 32.2
HC CA CB OG 314.6 295.9
HC CA CB HBC1 189.3 177.1
HC CA CB HBC2 79.9 56.0
HN1 N CA HN2 240.0 166.6
C CA N HC 244.8 242.8
CB CA N HC 116.2 121.5
N CA C O 66.0 324.2
C CA N CB 128.7 121.3
N CA C OXT 246.1 146.3
N CA CB OG 197.4 178.2
N CA CB HBC1 72.1 59.4
N CA CB HBC2 322.7 298.3
C CA N HN1 45.7 58.7
C CA N HN2 165.7 252.2
N CA C HC 117.0 114.1
CB CA C HC 244.2 236.1
N CA C CB 232.8 238.0
O C CA OXT 179.9 177.8
C CA CB OG 69.5 58.8
C CA CB HBC1 304.2 300.0
C CA CB HBC2 194.8 178.9
CA C OXT HXT 52.7 177.8
O C CA HC 308.9 210.1
O C CA CB 193.2 86.2
CA C O OXT 180.1 182.4
O C OXT HXT 232.8 359.9
CB CA N HN1 277.1 297.5
CB CA N HN2 37.1 130.9
N CA CB HC 242.8 242.3
C CA CB HC 114.9 122.9
N CA CB C 127.9 119.4
CB CA C O 193.2 86.2
CB CA C OXT 13.3 268.3
CA CB OG P1 217.0 180.0
OG CB CA HBC1 125.3 118.8
OG CB CA HBC2 234.7 239.9
HBC1 CB CA HBC2 109.4 121.1
OG CB CA HC 314.6 295.9
CA CB OG HBC1 234.7 239.2
CA CB OG HBC2 125.3 121.9
CB OG P1 O3 156.4 171.0
CB OG P1 O4 35.8 51.9
CB OG P1 N2 268.4 300.0
HBC1 CB OG HBC2 250.6 242.6
P1 OG CB HBC1 342.3 300.7
P1 OG CB HBC2 91.7 58.1
O3 P1 OG O4 120.6 119.1
O3 P1 OG N2 248.0 231.0
O4 P1 OG N2 127.4 111.9
OG P1 O4 H4 180.0 112.8
OG P1 N2 H2N1 54.7 169.7
OG P1 N2 H2N2 180.0 296.8
OG P1 O3 O4 252.6 246.8
OG P1 O3 N2 135.6 124.3
O4 P1 O3 N2 243.1 237.5
O3 P1 O4 H4 78.8 353.7
O3 P1 N2 H2N1 162.3 295.9
O3 P1 N2 H2N2 287.5 63.1
OG P1 O4 O3 101.2 119.2
OG P1 O4 N2 217.2 247.1
O3 P1 O4 N2 116.0 127.9
O4 P1 N2 H2N1 288.0 60.9
O4 P1 N2 H2N2 53.3 188.1
OG P1 N2 O3 252.5 233.8
OG P1 N2 O4 126.7 108.8
O3 P1 N2 O4 234.2 235.0
N2 P1 O4 H4 322.8 225.7
H2N1 N2 P1 H2N2 234.7 232.8
OXT C CA HC 129.0 32.2
CA C OXT O 179.9 177.9
OXT C CA CB 13.3 268.3
HBC1 CB CA HC 189.3 177.1
CA CB HBC1 OG 125.1 119.6
CA CB HBC1 HBC2 242.6 237.1
HBC1 CB OG P1 342.3 300.7
OG CB HBC1 HBC2 117.4 117.5
HBC2 CB CA HC 79.9 56.0
CA CB HBC2 OG 234.9 239.6
CA CB HBC2 HBC1 117.5 122.6
HBC2 CB OG P1 91.7 58.1
OG CB HBC2 HBC1 242.6 243.0
H4 O4 P1 N2 322.8 225.7
P1 N2 H2N1 H2N2 141.9 132.5
P1 N2 H2N2 H2N1 234.7 227.5