PDB Chemical Component PON

The following tables include covalent bond distance, bond angle and torsion angle values for the experimental model and ideal geometries stored in the definition for this chemical component.

Bond Distances for PON

Atom I	Atom J	Distance (Experimental Model)	Distance (Ideal Model)
P1	O1	1.503	1.545
P1	O2	1.495	1.610
P1	O3	1.589	1.610
P1	O4	1.589	1.545
O2	HO2	0.950	0.967
O3	P2	1.552	1.609
P2	O5	1.475	1.610
P2	O6	1.534	1.610
P2	N7	1.490	1.553
O5	HO5	0.950	0.967
N7	H7	1.020	0.970

Bond Angles for PON

Atom I	Atom J	Atom K	Angle (Experimental Model)	Angle (Ideal Model)
O1	P1	O2	119.6	109.5
O1	P1	O3	109.7	109.4
O1	P1	O4	106.9	109.5
O2	P1	O3	111.0	109.5
O2	P1	O4	103.9	109.5
P1	O2	HO2	119.6	106.8
O3	P1	O4	104.3	109.5
P1	O3	P2	160.4	106.8
O3	P2	O5	112.1	109.5
O3	P2	O6	110.7	109.5
O3	P2	N7	112.3	109.5
O5	P2	O6	104.8	109.4
O5	P2	N7	110.4	109.5
P2	O5	HO5	112.1	106.8
O6	P2	N7	106.2	109.4
P2	N7	H7	110.8	120.1

Torsion Angles for PON

Atom I	Atom J	Atom K	Atom L	Angle (Experimental Model)	Angle (Ideal Model)
O2	P1	O1	O3	130.0	120.0
O2	P1	O1	O4	242.5	240.0
O1	P1	O2	HO2	180.0	60.0
O3	P1	O1	O4	112.5	120.0
O1	P1	O3	P2	245.7	285.0
O1	P1	O2	O3	230.6	240.0
O1	P1	O2	O4	119.1	120.0
O3	P1	O2	O4	248.5	240.0
O2	P1	O3	P2	111.2	165.0
O1	P1	O3	O2	134.5	120.0
O1	P1	O3	O4	245.8	240.0
O2	P1	O3	O4	111.3	120.0
O3	P1	O2	HO2	309.4	180.0
P1	O3	P2	O5	179.5	60.0
P1	O3	P2	O6	63.0	300.0
P1	O3	P2	N7	304.5	180.0
O1	P1	O4	O2	232.6	240.0
O1	P1	O4	O3	116.2	119.9
O2	P1	O4	O3	243.6	240.0
O4	P1	O2	HO2	60.9	300.0
O4	P1	O3	P2	359.9	45.0
HO2	O2	P1	O3	309.4	180.0
HO2	O2	P1	O4	60.9	300.0
P2	O3	P1	O4	359.9	45.0
O5	P2	O3	O6	116.6	120.0
O5	P2	O3	N7	235.1	240.0
O3	P2	O5	HO5	180.0	60.0
O6	P2	O3	N7	118.5	120.0
O3	P2	N7	H7	154.9	180.0
O3	P2	O5	O6	239.9	240.0
O3	P2	O5	N7	126.0	120.1
O6	P2	O5	N7	246.1	240.1
O5	P2	N7	H7	280.8	300.0
O3	P2	O6	O5	121.0	120.0
O3	P2	O6	N7	237.9	239.9
O5	P2	O6	N7	116.9	120.0
O6	P2	O5	HO5	300.2	180.0
O6	P2	N7	H7	33.8	60.0
O3	P2	N7	O5	234.1	240.0
O3	P2	N7	O6	121.1	120.0
O5	P2	N7	O6	247.0	240.1
N7	P2	O5	HO5	54.1	300.0
HO5	O5	P2	O6	300.2	180.0
HO5	O5	P2	N7	54.1	300.0