PDB Chemical Component IME

The following tables include covalent bond distance, bond angle and torsion angle values for the experimental model and ideal geometries stored in the definition for this chemical component.

Bond Distances for IME

Atom I Atom J Distance (Experimental Model) Distance (Ideal Model)
CU O1 2.537  
CU O2 2.515  
CU NEC 2.024  
CU NEM 2.000  
CU NEW 2.000  
CU NE6 1.958  
O1 HO1 0.950  
O2 HO2 0.950  
CG1 CDC 1.353  
CG1 NDB 1.376  
CG1 HG1 1.080  
CDC NEC 1.374  
CDC HD21 1.080  
NDB CEB 1.323  
CEB NEC 1.325  
CEB HE11 1.080  
CG2 CDM 1.354  
CG2 NDL 1.377  
CG2 HG2 1.080  
CDM NEM 1.375  
CDM HD22 1.080  
NDL CEL 1.321  
CEL NEM 1.322  
CEL HE12 1.080  
CG3 CDW 1.354  
CG3 NDV 1.377  
CG3 HG3 1.080  
CDW NEW 1.375  
CDW HD23 1.080  
NDV CEV 1.321  
CEV NEW 1.322  
CEV HE13 1.080  
CG4 CD6 1.354  
CG4 ND5 1.378  
CG4 HG4 1.080  
CD6 NE6 1.374  
CD6 HD24 1.080  
ND5 CE5 1.318  
CE5 NE6 1.323  
CE5 HE14 1.080  
O1 H15 0.950  
O2 H16 0.950  

Bond Angles for IME

Atom I Atom J Atom K Angle (Experimental Model) Angle (Ideal Model)
O1 CU O2 171.6  
O1 CU NEC 97.6  
O1 CU NEM 97.4  
O1 CU NEW 84.1  
O1 CU NE6 90.3  
CU O1 HO1 109.5  
CU O1 H15 109.5  
O2 CU NEC 90.6  
O2 CU NEM 81.4  
O2 CU NEW 87.6  
O2 CU NE6 92.4  
CU O2 HO2 109.5  
CU O2 H16 109.5  
NEC CU NEM 87.6  
NEC CU NEW 178.2  
NEC CU NE6 82.0  
CU NEC CDC 125.3  
CU NEC CEB 128.9  
NEM CU NEW 91.6  
NEM CU NE6 167.9  
CU NEM CDM 131.1  
CU NEM CEL 130.8  
NEW CU NE6 98.6  
CU NEW CDW 123.5  
CU NEW CEV 131.9  
CU NE6 CD6 147.3  
CU NE6 CE5 123.0  
HO1 O1 H15 109.5  
HO2 O2 H16 109.5  
CDC CG1 NDB 107.3  
CDC CG1 HG1 126.4  
CG1 CDC NEC 108.5  
CG1 CDC HD21 125.7  
NDB CG1 HG1 126.3  
CG1 NDB CEB 106.3  
NEC CDC HD21 125.8  
CDC NEC CEB 105.6  
NDB CEB NEC 112.3  
NDB CEB HE11 123.8  
NEC CEB HE11 123.9  
CDM CG2 NDL 106.7  
CDM CG2 HG2 126.7  
CG2 CDM NEM 113.4  
CG2 CDM HD22 123.3  
NDL CG2 HG2 126.7  
CG2 NDL CEL 101.6  
NEM CDM HD22 123.3  
CDM NEM CEL 97.7  
NDL CEL NEM 120.6  
NDL CEL HE12 119.7  
NEM CEL HE12 119.7  
CDW CG3 NDV 110.6  
CDW CG3 HG3 124.7  
CG3 CDW NEW 106.9  
CG3 CDW HD23 126.6  
NDV CG3 HG3 124.7  
CG3 NDV CEV 102.2  
NEW CDW HD23 126.5  
CDW NEW CEV 104.5  
NDV CEV NEW 115.8  
NDV CEV HE13 122.1  
NEW CEV HE13 122.1  
CD6 CG4 ND5 99.3  
CD6 CG4 HG4 130.4  
CG4 CD6 NE6 123.2  
CG4 CD6 HD24 118.4  
ND5 CG4 HG4 130.4  
CG4 ND5 CE5 103.4  
NE6 CD6 HD24 118.4  
CD6 NE6 CE5 89.6  
ND5 CE5 NE6 124.5  
ND5 CE5 HE14 117.7  
NE6 CE5 HE14 117.7  

Torsion Angles for IME

Atom I Atom J Atom K Atom L Angle (Experimental Model) Angle (Ideal Model)
O2 CU O1 NEC 190.4  
O2 CU O1 NEM 278.9  
O2 CU O1 NEW 9.8  
O2 CU O1 NE6 108.4  
O1 CU O2 HO2 180.0  
O1 CU O2 H16 300.0  
NEC CU O1 NEM 88.6  
NEC CU O1 NEW 179.4  
NEC CU O1 NE6 278.0  
O1 CU NEC CDC 352.8  
O1 CU NEC CEB 178.4  
NEM CU O1 NEW 90.8  
NEM CU O1 NE6 189.4  
O1 CU NEM CDM 220.7  
O1 CU NEM CEL 49.1  
NEW CU O1 NE6 98.6  
O1 CU NEW CDW 190.6  
O1 CU NEW CEV 8.7  
O1 CU NE6 CD6 214.0  
O1 CU NE6 CE5 36.5  
HO1 O1 CU H15 240.0  
O1 CU O2 NEC 169.7  
O1 CU O2 NEM 82.2  
O1 CU O2 NEW 350.3  
O1 CU O2 NE6 251.8  
O2 CU O1 HO1 180.0  
O2 CU O1 H15 300.0  
NEC CU O2 NEM 272.5  
NEC CU O2 NEW 180.6  
NEC CU O2 NE6 82.1  
O2 CU NEC CDC 171.3  
O2 CU NEC CEB 356.9  
NEM CU O2 NEW 268.1  
NEM CU O2 NE6 169.6  
O2 CU NEM CDM 32.3  
O2 CU NEM CEL 220.7  
NEW CU O2 NE6 261.5  
O2 CU NEW CDW 12.0  
O2 CU NEW CEV 190.1  
O2 CU NE6 CD6 42.0  
O2 CU NE6 CE5 224.5  
HO2 O2 CU H16 240.0  
O1 CU NEC O2 181.5  
O1 CU NEC NEM 262.9  
O1 CU NEC NEW 199.6  
O1 CU NEC NE6 89.2  
NEC CU O1 HO1 349.6  
NEC CU O1 H15 109.6  
O2 CU NEC NEM 81.3  
O2 CU NEC NEW 18.1  
O2 CU NEC NE6 267.7  
NEC CU O2 HO2 10.2  
NEC CU O2 H16 130.3  
NEM CU NEC NEW 296.7  
NEM CU NEC NE6 186.4  
NEC CU NEM CDM 123.3  
NEC CU NEM CEL 311.7  
NEW CU NEC NE6 249.6  
NEC CU NEW CDW 30.1  
NEC CU NEW CEV 208.3  
NEC CU NE6 CD6 311.6  
NEC CU NE6 CE5 134.1  
CG1 CDC NEC CU 184.6  
CU NEC CDC HD21 4.6  
CDC NEC CU CEB 174.4  
NDB CEB NEC CU 175.3  
CU NEC CEB HE11 355.2  
O1 CU NEM O2 188.4  
O1 CU NEM NEC 97.4  
O1 CU NEM NEW 275.8  
O1 CU NEM NE6 128.8  
NEM CU O1 HO1 261.0  
NEM CU O1 H15 21.1  
O2 CU NEM NEC 269.0  
O2 CU NEM NEW 87.4  
O2 CU NEM NE6 300.4  
NEM CU O2 HO2 97.7  
NEM CU O2 H16 217.8  
NEC CU NEM NEW 178.4  
NEC CU NEM NE6 31.4  
NEM CU NEC CDC 90.0  
NEM CU NEC CEB 275.6  
NEW CU NEM NE6 213.1  
NEM CU NEW CDW 93.3  
NEM CU NEW CEV 271.5  
NEM CU NE6 CD6 343.4  
NEM CU NE6 CE5 165.9  
CG2 CDM NEM CU 186.4  
CU NEM CDM HD22 6.3  
CDM NEM CU CEL 171.6  
NDL CEL NEM CU 173.6  
CU NEM CEL HE12 353.6  
O1 CU NEW O2 178.6  
O1 CU NEW NEC 160.5  
O1 CU NEW NEM 97.3  
O1 CU NEW NE6 270.6  
NEW CU O1 HO1 170.2  
NEW CU O1 H15 290.2  
O2 CU NEW NEC 341.9  
O2 CU NEW NEM 278.7  
O2 CU NEW NE6 92.0  
NEW CU O2 HO2 189.7  
NEW CU O2 H16 309.7  
NEC CU NEW NEM 296.8  
NEC CU NEW NE6 110.2  
NEW CU NEC CDC 153.2  
NEW CU NEC CEB 338.8  
NEM CU NEW NE6 173.3  
NEW CU NEM CDM 304.9  
NEW CU NEM CEL 133.3  
NEW CU NE6 CD6 129.9  
NEW CU NE6 CE5 312.4  
CG3 CDW NEW CU 178.5  
CU NEW CDW HD23 358.5  
CDW NEW CU CEV 181.9  
NDV CEV NEW CU 181.6  
CU NEW CEV HE13 1.7  
O1 CU NE6 O2 172.0  
O1 CU NE6 NEC 262.4  
O1 CU NE6 NEM 230.6  
O1 CU NE6 NEW 84.1  
NE6 CU O1 HO1 71.6  
NE6 CU O1 H15 191.6  
O2 CU NE6 NEC 90.3  
O2 CU NE6 NEM 58.6  
O2 CU NE6 NEW 272.0  
NE6 CU O2 HO2 288.2  
NE6 CU O2 H16 48.2  
NEC CU NE6 NEM 328.2  
NEC CU NE6 NEW 181.7  
NE6 CU NEC CDC 263.6  
NE6 CU NEC CEB 89.2  
NEM CU NE6 NEW 213.5  
NE6 CU NEM CDM 91.8  
NE6 CU NEM CEL 280.3  
NE6 CU NEW CDW 280.0  
NE6 CU NEW CEV 98.1  
CG4 CD6 NE6 CU 182.0  
CU NE6 CD6 HD24 2.0  
CD6 NE6 CU CE5 177.5  
ND5 CE5 NE6 CU 178.6  
CU NE6 CE5 HE14 358.6  
HO1 O1 CU O2 180.0  
HO1 O1 CU NEC 349.6  
HO1 O1 CU NEM 261.0  
HO1 O1 CU NEW 170.2  
HO1 O1 CU NE6 71.6  
CU O1 HO1 H15 120.0  
HO2 O2 CU NEC 10.2  
HO2 O2 CU NEM 97.7  
HO2 O2 CU NEW 189.7  
HO2 O2 CU NE6 288.2  
CU O2 HO2 H16 120.0  
CU NEC CDC CG1 184.6  
NDB CG1 CDC HG1 180.0  
CDC CG1 NDB CEB 0.2  
NEC CDC CG1 HD21 180.0  
CG1 CDC NEC CEB 0.1  
CDC CG1 NDB HG1 180.0  
NDB CG1 CDC NEC 359.8  
NDB CG1 CDC HD21 179.8  
CG1 NDB CEB NEC 359.9  
CG1 NDB CEB HE11 179.9  
CDC CG1 HG1 NDB 180.0  
HG1 CG1 CDC NEC 179.9  
HG1 CG1 CDC HD21 359.9  
HG1 CG1 NDB CEB 180.1  
CDC NEC CU NEM 90.0  
CDC NEC CU NEW 153.2  
CDC NEC CU NE6 263.6  
CU NEC CDC CEB 184.5  
NEC CDC CG1 NDB 359.8  
NEC CDC CG1 HG1 179.9  
CG1 CDC NEC HD21 180.0  
NDB CEB NEC CDC 360.0  
CDC NEC CEB HE11 180.0  
HD21 CDC CG1 NDB 179.8  
HD21 CDC CG1 HG1 359.9  
CG1 CDC HD21 NEC 180.0  
HD21 CDC NEC CEB 180.1  
CU NEC CEB NDB 175.3  
CEB NDB CG1 HG1 180.1  
CDC NEC CEB NDB 360.0  
NEC CEB NDB HE11 180.0  
CEB NEC CU NEM 275.6  
CEB NEC CU NEW 338.8  
CEB NEC CU NE6 89.2  
CU NEC CEB CDC 175.3  
CEB NEC CDC HD21 180.1  
NDB CEB NEC HE11 180.0  
NDB CEB HE11 NEC 180.0  
CU NEM CDM CG2 186.4  
NDL CG2 CDM HG2 180.0  
CDM CG2 NDL CEL 359.9  
NEM CDM CG2 HD22 180.0  
CG2 CDM NEM CEL 359.9  
CDM CG2 NDL HG2 180.0  
NDL CG2 CDM NEM 0.1  
NDL CG2 CDM HD22 180.1  
CG2 NDL CEL NEM 0.1  
CG2 NDL CEL HE12 180.1  
CDM CG2 HG2 NDL 180.0  
HG2 CG2 CDM NEM 180.1  
HG2 CG2 CDM HD22 0.1  
HG2 CG2 NDL CEL 179.9  
CDM NEM CU NEW 304.9  
CDM NEM CU NE6 91.8  
CU NEM CDM CEL 186.4  
NEM CDM CG2 NDL 0.1  
NEM CDM CG2 HG2 180.1  
CG2 CDM NEM HD22 180.0  
NDL CEL NEM CDM 360.0  
CDM NEM CEL HE12 180.0  
HD22 CDM CG2 NDL 180.1  
HD22 CDM CG2 HG2 0.1  
CG2 CDM HD22 NEM 180.0  
HD22 CDM NEM CEL 179.9  
CU NEM CEL NDL 173.6  
CEL NDL CG2 HG2 179.9  
CDM NEM CEL NDL 360.0  
NEM CEL NDL HE12 180.0  
CEL NEM CU NEW 133.3  
CEL NEM CU NE6 280.3  
CU NEM CEL CDM 173.6  
CEL NEM CDM HD22 179.9  
NDL CEL NEM HE12 180.0  
NDL CEL HE12 NEM 180.0  
CU NEW CDW CG3 178.5  
NDV CG3 CDW HG3 180.0  
CDW CG3 NDV CEV 359.9  
NEW CDW CG3 HD23 180.0  
CG3 CDW NEW CEV 359.9  
CDW CG3 NDV HG3 180.0  
NDV CG3 CDW NEW 0.1  
NDV CG3 CDW HD23 180.1  
CG3 NDV CEV NEW 0.0  
CG3 NDV CEV HE13 180.0  
CDW CG3 HG3 NDV 180.0  
HG3 CG3 CDW NEW 180.1  
HG3 CG3 CDW HD23 0.1  
HG3 CG3 NDV CEV 179.9  
CDW NEW CU NE6 280.0  
CU NEW CDW CEV 178.6  
NEW CDW CG3 NDV 0.1  
NEW CDW CG3 HG3 180.1  
CG3 CDW NEW HD23 180.0  
NDV CEV NEW CDW 0.0  
CDW NEW CEV HE13 180.1  
HD23 CDW CG3 NDV 180.1  
HD23 CDW CG3 HG3 0.1  
CG3 CDW HD23 NEW 180.0  
HD23 CDW NEW CEV 179.9  
CU NEW CEV NDV 181.6  
CEV NDV CG3 HG3 179.9  
CDW NEW CEV NDV 0.0  
NEW CEV NDV HE13 180.0  
CEV NEW CU NE6 98.1  
CU NEW CEV CDW 181.6  
CEV NEW CDW HD23 179.9  
NDV CEV NEW HE13 180.0  
NDV CEV HE13 NEW 180.0  
CU NE6 CD6 CG4 182.0  
ND5 CG4 CD6 HG4 180.0  
CD6 CG4 ND5 CE5 359.9  
NE6 CD6 CG4 HD24 180.0  
CG4 CD6 NE6 CE5 359.9  
CD6 CG4 ND5 HG4 180.0  
ND5 CG4 CD6 NE6 0.1  
ND5 CG4 CD6 HD24 180.1  
CG4 ND5 CE5 NE6 0.1  
CG4 ND5 CE5 HE14 180.1  
CD6 CG4 HG4 ND5 180.0  
HG4 CG4 CD6 NE6 180.1  
HG4 CG4 CD6 HD24 0.1  
HG4 CG4 ND5 CE5 179.9  
CU NE6 CD6 CE5 182.1  
NE6 CD6 CG4 ND5 0.1  
NE6 CD6 CG4 HG4 180.1  
CG4 CD6 NE6 HD24 180.0  
ND5 CE5 NE6 CD6 360.0  
CD6 NE6 CE5 HE14 180.0  
HD24 CD6 CG4 ND5 180.1  
HD24 CD6 CG4 HG4 0.1  
CG4 CD6 HD24 NE6 180.0  
HD24 CD6 NE6 CE5 179.9  
CU NE6 CE5 ND5 178.6  
CE5 ND5 CG4 HG4 179.9  
CD6 NE6 CE5 ND5 360.0  
NE6 CE5 ND5 HE14 180.0  
CU NE6 CE5 CD6 178.6  
CE5 NE6 CD6 HD24 179.9  
ND5 CE5 NE6 HE14 180.0  
ND5 CE5 HE14 NE6 180.0  
H15 O1 CU O2 300.0  
H15 O1 CU NEC 109.6  
H15 O1 CU NEM 21.1  
H15 O1 CU NEW 290.2  
H15 O1 CU NE6 191.6  
CU O1 H15 HO1 240.0  
H16 O2 CU NEC 130.3  
H16 O2 CU NEM 217.8  
H16 O2 CU NEW 309.7  
H16 O2 CU NE6 48.2  
CU O2 H16 HO2 239.9