PDB Chemical Component 50L

The following tables include covalent bond distance, bond angle and torsion angle values for the experimental model and ideal geometries stored in the definition for this chemical component.

Bond Distances for 50L

Atom I Atom J Distance (Experimental Model) Distance (Ideal Model)
O7 P1 1.484  
P1 O6 1.486  
P1 O2 1.595  
C10 C1 1.331  
C10 N5 1.339  
C1 N1 1.334  
O1 C2 1.231  
O2 C5 1.420  
C5 C6 1.506  
O3 C6 1.445  
O3 C9 1.416  
N5 C2 1.337  
N5 C4 1.334  
C2 N2 1.335  
N1 C4 1.327  
N1 C9 1.465  
C6 C7 1.508  
C4 N4 1.342  
C9 C8 1.523  
N2 C3 1.337  
N4 C3 1.356  
C3 N3 1.335  
C7 C8 1.520  
C7 O4 1.406  
C8 O5 1.421  
C1 H1 1.080  
N3 H2 1.000  
N3 H3 1.000  
N4 H4 1.000  
C5 H5 1.100  
C5 H6 1.100  
C6 H7 1.099  
C7 H8 1.100  
O4 H9 0.950  
C8 H10 1.101  
O5 H11 0.950  
C9 H12 1.100  
C10 H13 1.080  
O7 H15 0.950  
P1 O8 1.609  
O8 H17 0.950  

Bond Angles for 50L

Atom I Atom J Atom K Angle (Experimental Model) Angle (Ideal Model)
O7 P1 O8 107.3  
O2 P1 O6 108.9  
O6 P1 O8 108.3  
P1 O2 C5 120.9  
O2 P1 O8 103.5  
C10 C1 H1 126.3  
C1 N1 C4 109.1  
C1 N1 C9 120.4  
O1 C2 N2 119.4  
O2 C5 C6 111.1  
O2 C5 H5 109.0  
O2 C5 H6 109.0  
C5 C6 C7 115.1  
C6 C5 H5 109.1  
C6 C5 H6 109.1  
C5 C6 H7 108.9  
O3 C6 C7 103.2  
O3 C6 H7 109.7  
N1 C9 O3 107.6  
O3 C9 C8 107.5  
O3 C9 H12 109.4  
C2 N2 C3 120.4  
C4 N1 C9 130.2  
N1 C4 N4 134.2  
N1 C9 C8 115.5  
N1 C9 H12 108.7  
C6 C7 C8 102.0  
C6 C7 O4 111.2  
C7 C6 H7 108.9  
C6 C7 H8 109.4  
C4 N4 H4 120.4  
C9 C8 H10 112.3  
N2 C3 N3 117.1  
C3 N3 H2 120.0  
C3 N3 H3 120.0  
O4 C7 C8 113.9  
C7 C8 O5 109.8  
C8 C7 H8 109.2  
C7 C8 H10 112.4  
O4 C7 H8 110.8  
C7 O4 H9 109.5  
O5 C8 H10 114.0  
C8 O5 H11 109.5  
H2 N3 H3 120.0  
H5 C5 H6 109.5  
P1 O8 H17 109.5  

Torsion Angles for 50L

Atom I Atom J Atom K Atom L Angle (Experimental Model) Angle (Ideal Model)
O6 P1 O7 O8 236.8  
O2 P1 O7 O8 111.4  
O7 P1 O8 H17 230.5  
O7 P1 O6 O8 122.7  
O6 P1 O2 C5 64.6  
O2 P1 O6 O8 248.1  
O6 P1 O8 H17 0.0  
O7 P1 O2 O8 246.1  
O6 P1 O2 O8 115.0  
P1 O2 C5 C6 169.8  
P1 O2 C5 H5 290.1  
P1 O2 C5 H6 49.5  
O2 P1 O8 H17 115.5  
N5 C10 C1 H1 181.3  
C1 N1 C9 O3 11.1  
C4 N1 C1 C9 175.0  
C1 N1 C4 N4 180.1  
C1 N1 C9 C8 251.1  
C1 N1 C9 H12 129.5  
O1 C2 N2 C3 180.1  
C5 O2 P1 O6 64.6  
C5 O2 P1 O8 309.6  
O2 C5 C6 C7 45.6  
C6 C5 O2 H5 239.7  
C6 C5 O2 H6 120.3  
O2 C5 C6 H7 168.1  
H5 C5 O2 H6 240.5  
O2 C5 C6 H5 120.3  
O2 C5 C6 H6 239.8  
O3 C6 C5 C7 243.4  
O3 C6 C5 H7 120.8  
C5 C6 C7 C8 199.3  
C5 C6 C7 O4 77.5  
C7 C6 C5 H7 237.5  
C5 C6 C7 H8 314.8  
H5 C5 C6 H6 119.5  
C5 C6 O3 C7 123.7  
O3 C6 C5 H5 168.7  
O3 C6 C5 H6 49.2  
C5 C6 O3 H7 239.7  
N1 C9 O3 C6 236.4  
O3 C6 C7 C8 320.3  
O3 C6 C7 O4 198.5  
C7 C6 O3 H7 115.9  
O3 C6 C7 H8 75.8  
C9 O3 C6 C7 24.1  
C9 O3 C6 H7 268.2  
C4 N1 C9 O3 197.3  
N1 C9 O3 C8 235.0  
N1 C9 O3 H12 118.0  
O3 C9 C8 H10 214.6  
N5 C4 N4 H4 179.4  
C2 N2 C3 N3 180.1  
C1 N1 C4 C9 185.6  
C4 N1 C9 C8 77.2  
C4 N1 C9 H12 315.7  
N1 C4 N4 H4 1.0  
C1 N1 C9 C4 173.9  
O3 C9 N1 C8 120.0  
O3 C9 N1 H12 241.6  
C9 N1 C4 N4 354.5  
N1 C9 C8 H10 334.8  
C7 C6 C5 H5 285.3  
C7 C6 C5 H6 165.8  
C5 C6 C7 H7 122.6  
O3 C6 C7 H7 243.5  
O4 C7 C6 C8 238.2  
C6 C7 C8 O5 286.9  
C8 C7 C6 H8 244.5  
C6 C7 C8 H10 158.9  
O4 C7 C6 H8 122.7  
C6 C7 O4 H9 180.0  
N4 C4 N1 C9 354.5  
N1 C9 C8 O3 120.1  
O3 C9 C8 H12 117.9  
N1 C9 C8 H12 238.1  
C9 C8 C7 H8 283.7  
C7 C8 C9 H10 119.6  
O5 C8 C9 H10 234.1  
C9 C8 O5 H11 180.0  
N2 C3 N3 H2 0.0  
N2 C3 N3 H3 180.0  
N1 C4 N4 C3 181.0  
N4 C3 N3 H2 180.2  
N4 C3 N3 H3 0.1  
H2 N3 C3 H3 180.0  
O3 C9 C8 C7 334.2  
N1 C9 C8 C7 94.3  
C6 C7 C8 O4 240.1  
C8 C7 C6 H7 76.8  
C6 C7 C8 H8 115.6  
C9 C8 C7 H10 240.5  
O4 C7 C8 H8 235.6  
C8 C7 O4 H9 65.4  
O5 C8 C7 H10 128.0  
C7 C8 O5 H11 288.1  
C6 C7 O4 C8 114.6  
O4 C7 C6 H7 315.0  
C6 C7 O4 H8 238.1  
O4 C7 C8 O5 46.9  
C8 C7 O4 H8 123.5  
O4 C7 C8 H10 278.8  
O3 C9 C8 O5 88.8  
N1 C9 C8 O5 208.9  
C9 C8 O5 H10 124.8  
O5 C8 C7 H8 171.3  
C7 C8 O5 H10 232.9  
H1 C1 N1 C4 178.2  
H1 C1 N1 C9 3.1  
C3 N3 H2 H3 180.0  
C3 N3 H3 H2 180.0  
O2 C5 H5 C6 238.5  
O2 C5 H5 H6 119.2  
H5 C5 C6 C7 285.3  
C6 C5 H5 H6 240.8  
H5 C5 C6 H7 47.8  
O2 C5 H6 C6 121.5  
O2 C5 H6 H5 240.8  
H6 C5 C6 C7 165.8  
C6 C5 H6 H5 119.3  
H6 C5 C6 H7 288.3  
C5 C6 H7 C7 233.8  
H7 C6 C5 H5 47.8  
H7 C6 C5 H6 288.3  
O3 C6 H7 C7 112.3  
H7 C6 C7 C8 76.8  
H7 C6 C7 O4 315.0  
H7 C6 C7 H8 192.3  
C6 C7 H8 C8 249.2  
C6 C7 H8 O4 122.9  
H8 C7 C6 H7 192.3  
O4 C7 H8 C8 126.2  
H8 C7 C8 O5 171.3  
H8 C7 C8 H10 43.2  
H8 C7 O4 H9 301.9  
H9 O4 C7 C8 65.4  
H9 O4 C7 H8 301.9  
C7 C8 H10 O5 125.8  
H10 C8 C7 H8 43.2  
H10 C8 O5 H11 55.2  
H11 O5 C8 H10 55.2  
N1 C9 H12 O3 242.7  
O3 C9 H12 C8 243.3  
N1 C9 H12 C8 126.0  
H12 C9 C8 H10 96.7  
H13 C10 C1 H1 1.3  
H15 O7 P1 O8 123.2  
O2 P1 O8 O6 115.5  
O8 P1 O2 C5 309.6