PDB Chemical Component 0JX

The following tables include covalent bond distance, bond angle and torsion angle values for the experimental model and ideal geometries stored in the definition for this chemical component.

Bond Distances for 0JX

Atom I Atom J Distance (Experimental Model) Distance (Ideal Model)
O20 P17 1.484 1.480
O14 P13 1.481 1.479
P17 O16 1.576 1.610
P17 O19 1.472 1.609
P17 O18 1.449 1.611
O15 P13 1.483 1.611
O16 P13 1.544 1.610
P13 O29 1.531 1.610
O29 C28 1.429 1.429
C27 C28 1.495 1.529
C27 C30 1.461 1.507
C13 C30 1.353 1.317
C13 O33 1.363 1.357
O19 H1 0.950 0.967
O18 H2 0.950 0.968
O15 H3 0.950 0.968
C28 H4 1.100 1.090
C28 H5 1.100 1.090
C27 H6 1.100 1.090
C27 H7 1.100 1.090
C30 H9 1.080 1.079
C13 H11 1.080 1.080
O33 H12 0.950 0.967

Bond Angles for 0JX

Atom I Atom J Atom K Angle (Experimental Model) Angle (Ideal Model)
O20 P17 O16 105.5 109.5
O20 P17 O19 113.0 109.5
O20 P17 O18 115.5 109.5
O14 P13 O29 113.0 109.5
O19 P17 O16 93.9 109.5
O18 P17 O16 110.1 109.4
P17 O16 P13 139.8 134.0
O19 P17 O18 115.9 109.5
P17 O19 H1 109.5 114.0
P17 O18 H2 109.5 114.0
O15 P13 O29 103.6 109.5
O16 P13 O29 104.6 109.5
P13 O29 C28 123.5 123.0
O29 C28 H4 109.4 109.4
O29 C28 H5 109.4 109.4
C27 C28 H4 109.4 109.5
C27 C28 H5 109.4 109.5
C30 C27 H6 108.5 109.5
C30 C27 H7 108.6 109.5
C27 C30 H9 126.2 120.0
C13 C30 H9 126.2 120.0
O33 C13 H11 128.3 120.0
C13 O33 H12 109.5 114.0
H4 C28 H5 109.5 109.4
H6 C27 H7 109.5 109.4

Torsion Angles for 0JX

Atom I Atom J Atom K Atom L Angle (Experimental Model) Angle (Ideal Model)
O19 P17 O20 O16 258.8 120.0
O18 P17 O20 O16 121.9 240.0
O20 P17 O16 P13 81.0 44.9
O19 P17 O20 O18 136.9 240.0
O20 P17 O19 H1 360.0 180.0
O20 P17 O18 H2 360.0 300.0
O15 P13 O14 O29 121.9 120.0
O16 P13 O14 O29 251.1 239.9
O14 P13 O29 C28 331.7 55.0
O20 P17 O16 O19 244.8 120.0
O20 P17 O16 O18 125.3 240.0
O19 P17 O16 O18 240.5 120.0
O16 P17 O19 H1 251.3 300.0
O16 P17 O18 H2 119.4 180.0
P17 O16 P13 O29 98.4 200.0
O20 P17 O19 O16 108.7 239.9
O20 P17 O19 O18 223.3 120.0
O18 P17 O19 O16 245.4 120.0
O19 P17 O16 P13 196.2 284.9
O19 P17 O18 H2 224.4 60.0
O20 P17 O18 O16 240.6 120.0
O20 P17 O18 O19 135.6 240.0
O19 P17 O18 O16 105.0 240.0
O18 P17 O16 P13 315.7 164.9
O18 P17 O19 H1 136.7 60.0
O14 P13 O15 O29 233.5 240.0
O16 P13 O15 O29 115.9 120.0
O15 P13 O29 C28 201.4 294.9
O14 P13 O16 O29 115.9 120.1
O15 P13 O16 O29 244.6 240.0
O16 P13 O29 C28 75.4 175.0
P13 O29 C28 H4 64.8 300.1
P13 O29 C28 H5 184.8 60.0
C27 C28 O29 H4 240.0 240.0
C27 C28 O29 H5 120.0 120.0
H4 C28 O29 H5 240.1 240.1
O29 C28 C27 H4 120.0 120.0
O29 C28 C27 H5 240.0 240.0
H4 C28 C27 H5 119.9 120.0
C30 C27 C28 H4 151.0 60.0
C30 C27 C28 H5 31.0 300.0
C13 C30 C27 H9 180.0 180.0
H6 C27 C30 H7 119.0 120.0
C13 C30 C27 H6 82.4 5.0
C13 C30 C27 H7 323.4 245.0
C27 C30 C13 H9 180.0 180.0
O33 C13 C30 H9 356.3 0.0
H1 O19 P17 O16 251.3 300.0
H1 O19 P17 O18 136.7 60.0
H2 O18 P17 O16 119.4 180.0
H3 O15 P13 O29 126.5 300.0
O29 C28 H4 H5 119.9 119.9
C27 C28 H4 H5 240.1 240.0
O29 C28 H5 H4 240.1 240.1
C27 C28 H5 H4 119.9 120.0
H6 C27 C28 H4 271.5 180.0
H6 C27 C28 H5 151.5 60.0
C30 C27 H6 H7 241.6 240.0
H6 C27 C30 H9 262.4 185.0
H7 C27 C28 H4 30.5 300.0
H7 C27 C28 H5 270.5 180.0
C30 C27 H7 H6 118.4 120.0
H7 C27 C30 H9 143.4 65.1
H9 C30 C27 H6 262.4 185.0
H9 C30 C27 H7 143.4 65.1
H11 C13 C30 H9 176.3 179.9
H11 C13 O33 H12 360.0 0.0
H12 O33 C13 H11 360.0 0.0